Des que s'ha posat en funcionament la Comissió Bilateral s'han iniciat diversos procediments de negociació en el marc de l'article 33.2 Llei orgànica del Tribunal Constitucional, que han permès la resolució de les discrepàncies de forma negociada i han evitat la interposició del corresponent recurs d'inconstitucionalitat. Aquest mecanisme de negociació destaca com un important instrument per evitar la conflictivitat competencial amb l'Estat.
Procediments de negociació de conformitat amb l'article 33.2 LOTC
L'activitat de foment de l'Estat ha estat un àmbit en el qual sovint s'han generat controvèrsies i conflictivitat per l'afectació de les competències autonòmiques i per aquest motiu s'ha creat en el si de la Subcomissió de Seguiment Normatiu, Prevenció i Solució de Conflictes de la Comissió Bilateral Generalitat-Estat un Grup de Treball per analitzar el marc normatiu i l'activitat de foment en relació amb l'activitat subvencional de l'Estat i la seva incidència en la distribució de competències, que està duent a terme treballs per identificar els principals problemes fonamentals en aquest àmbit i reconduir-los a l'actual sistema de distribució competencial amb l'objectiu d'evitar la conflictivitat.
D'altra banda, fruit de l'estudi dels àmbits en els quals s'havia detectat que les propostes de regulació estatals no incorporaven suficientment els canvis que es desprenen del repartiment competencial, amb posterioritat a l'aprovació de l'Estatut d'autonomia de Catalunya, l'Estat va traslladar a tots els ministeris els criteris per adequar la normativa estatal a l'ordre constitucional de distribució de competències. Aquests criteris es van donar a conèixer a la Generalitat en l'àmbit de la Comissió Bilateral el mes de juliol de 2008.
